（一）標準的演變歷史不同
    ISO17025從 1978 年國際標準化組織 / 國際電工委員會的導則 25 的最初形成，發展到現在的 ISO17025：2005 這個體系標準已經經歷了 5 個版本。在這一過程中標準得到了不斷的完善,并充分考慮 ISO 9001 標準的內容，以加強兩標準的兼容性，強調管理體系的作用，要求不斷地改進管理系統的能力,以最大限度地滿足廣大客戶的需要。
     ISO9000 族標準：1987 年國際標準化組織在總結全面質量管理經驗的基礎上, 制定了 ISO 9000《質量管理和質量保證》系列標準。歷經了 1994 年和 2000 的 2 次修訂，后來隨著ISO17025 與 ISO 9001 標準的相互聯系全球經濟的變化、客觀認知的提高和標準自身的需要不斷發展和完善, 在廣泛征求全世界標準使用者和國際上質量管理專家意見的基礎上,國際標準化組織于進行了 ISO 9000 族標準的第 3 次換版 ，使標準的內容和要求更加明確完善、更具適用性，可操作性更強。2008 版 ISO 9001《質量管理體系要求》國際標準已于 2008 年 11 月 15 日正式發布。目前2015版本也開始實施，該標準非常有利于推廣，現在已經被世界絕大多數國家所采用。
 （二）適用范圍不同
    ISO/IEC17025 標準是針對實驗室的質量管理體系要求,是實驗室認可的通用技術要求，該標準適用于包括第一、二、三方在內的所有實驗室, 也是各國實驗室認可機構對實驗室認可的依據；
    ISO9001 是質量管理體系認證的主要標準，適用于所有行業或經濟領域, 任何組織都可以自愿建立并執行和維護該質量管理體系?？梢?ISO/IEC 17025 的認可是承認實驗室的能力,而 ISO 9000 的認證只是對質量管理體系的符合性確認。
（三）評價內容不同
     ISO/IEC17025標準包含了質量管理和技術方面的要求,其中技術要求共有 10 個要素，是標準的重要內容。而ISO9001 主要包含質量管理體系的要求。所以 ISO/IEC 17025∶2005 的條款 1.6 中描述: 如果檢測和校準實驗室遵守準則的要求，其針對檢測和校準所運作的質量管理體系也就滿足了ISO9001 的原則，該準則包含了 ISO9001 中未包含的技術能力要求，而如果實驗室獲得了 ISO 9001的認證，并不能證明實驗室就具備了出具技術上有效數據和結果的能力。ISO9001 認證只能證明實驗室具備完整的質量管理體系，即向顧客保證實驗室處于有效的質量管理體系中，但并不能保證其檢測或校準結果的技術可信度。
（四）實施主體不同
     實驗室認可活動的主體是權威機構, 而認可機構的權威常來自于政府,因此認可機構一般是由政府授權的。中國合格評定國家認可委員會(CNAS)是我國唯一的實驗室認可機構,由國務院授權建立的中國國家認證認可監督管理委員(CNCA)正式授權。
     ISO 9001 認證活動的主體可以是民間的、 私有的,也可以是官方的。認證機構以公正的身份依靠自身服務質量來樹立在行業中的威信,以此吸收顧客,不具有法律上的權威性。
 （五）實施客體不同
    實驗室認可活動的對象是合格評定機構，即提供下列合格評定服務的組織：校準、 檢測、 檢查、 管理體系認證、 人員注冊和產品認證，其目的是承認某機構或組織完成特定任務的能力或資格。認可機構評審的是某個機構從事特定檢測 / 校準、 檢查、 認證或人員注冊等活動的能力。這里的能力既包含了質量要求，又包括了技術要求。
    認證活動的對象是產品或體系，其目的是證明某產品或體系符合特定標準規定的要求。認證機構審核的則是某個機構生產 /提供的產品、過程、服務或質量管理體系對標準規定要求的符合性。
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